Juan Pablo II murió, a los 84 años, el sábado 2 de abril de 2005 a las 21:37 horas, después de una larga agonía que se prolongó 48 horas.

Su muerte la han ratificado los ritos cristianos llevados a cabo por el camarlengo. Se ha confirmardo con un viejo rito que consiste en golpear tres veces la frente del Pontífice con un martillo de plata, que figura en el escudo de armas pontificio, mientras se llama al difunto por su nombre de pila. El acto se realizó en presencia del maestro de celebraciones litúrgicas y del secretario y el canciller de la Cámara Apostólica. Este último es el encargado de rellenar el acta de defunción del Pontífice.

A continuación, se ha retirado del dedo el anillo del Pescador, símbolo del poder pontificio. Esta es la señal de que el reinado ha concluido. El anillo ha sido machacado junto con el sello de plomo del Papa ante los cardenales. Se hace para evitar cualquier eventual falsificación de documentos papales. A continuación, el camarlengo cierra con llave la habitación de Papa y su estudio. Estos aposentos no se abrirán hasta que no se elija un nuevo Papa.

El cadáver de Juan Pablo II ha sido expuesto en la sala Clementina de la Santa Sede, donde es honrado por la Curia romana y las principales autoridades italianas.